После событий первой части синий еж Соник обретает подобие дома в Грин-Хиллз, но тихая жизнь быстро сменяется новым вызовом. Злодей доктор Роботник, не смирившись с поражением, возвращается с амбициозным планом по завоеванию мира, для чего ему нужен Мистер Эггман — могущественный артефакт, известный как Хрустальный изумруд. Его ищет и загадочный и сильный воин Наклз, чьи мотивы остаются неясными.
Джеймс обладает редким даром — он видит будущее. Однако вместо использования способности для великих дел, он предпочитает жить на мелкие аферы, которые его дар позволяет легко проверять. Его мир, построенный на хитрости и избегании рисков, рушится в один миг, когда он соглашается на рискованное дело по переправке алмазов.