Фильм «Злой город» переносит зрителя в один из самых драматических и переломных моментов русской истории — осень 1238 года, когда после разорения Рязани, Владимира и Москвы несокрушимая монгольская орда хана Батыя остановилась у стен Новгорода. Великий город, окружённый мощными укреплениями и болотистыми просторами, казался недосягаемой добычей.
1927 год. Гигантская стальная магистраль — Транссибирский экспресс — мчится через бескрайние просторы России. В его вагонах, под маской обычных пассажиров, скрываются агенты иностранных разведок и безжалостные наёмники, чья цель — похитить или уничтожить пакет секретных документов. Эти бумаги способны перекроить геополитическую карту, определив судьбы молодого СССР и соседнего Китая.