Третья часть приключений знаменитых мутантов-воинов переносит героев из современного Нью-Йорка в японский период Сэнгоку. Всё начинается с безобидного подарка — старинного скипетра, купленного Эйприл для Сплинтера. Этот артефакт оказывается ключом к машине времени, но с ограничением: путешествие возможно только при равном весе в обеих эпохах.
