Действие разворачивается в мрачном и хаотичном Иронесбурге, последнем крупном городе на постапокалиптической Земле XXVI века. Среди мусора и обломков старых технологий врач-механик Доктор Идо находит останки женского киборга и, вопреки строгому запрету, восстанавливает её. Новая обитательница города, получившая имя Алита, лишена воспоминаний, но её тело хранит инстинкты смертоносного бойца.
