Роберт Родригес возвращает зрителей в яркий мир шпионских приключений, где героизм — это семейное дело. Кармен и Джуни Кортес, уже не дети, а заслуженные агенты секретной организации, получают новое задание: обезвредить изобретение под названием «трансмукер», способное отключить всю электронику на планете. Их путь пересекается с командой Гигглзов — Гэри и Герти, детей нового директора.
Вернувшись с полей Гражданской войны, братья Джесси и Фрэнк Джеймс обнаруживают, что их родной Либерти захвачен могущественным железнодорожным бароном Тадеушем Рейнсдом. Железная дорога, прокладываемая через город, должна стать причиной изгнания местных жителей, а в союзе с Рейнсдом действует легендарный сыщик Алан Пинкертон.