Легендарные братья-черепахи возвращаются в новом приключении, где их главный враг — Шреддер — получает неожиданное преимущество. С помощью профессора Стокмана, чьи технологии открывают путь между мирами, злодей готовит масштабный побег и план по захвату города. Эйприл О'Нил, раздобывшая ключевую информацию, становится связующим звеном между миром людей и подземельем, где обитают герои.
У четверых приятелей из уютного пригорода, чья жизнь давно свелась к еженедельным встречам в мотоклубе, внезапно вспыхивает ностальгия по былой свободе. Решив сбросить с себя оковы быта, они покупают мотоциклы, облачаются в кожаные куртки и отправляются в долгое путешествие от севера Америки до Нью-Мексико, назвавшись «Реальными кабанами».