В рамках расширенной вселенной «Звёздного пути» новый полнометражный фильм фокусируется на одной из самых противоречивых и сильных персонажей — императрице Филиппе Георгиу. После событий, которые изменили ход истории, она принимает предложение присоединиться к Секции 31, тайной организации, действующей в тени официальных структур Звёздного флота.
Талантливая и целеустремлённая ученица выпускного класса Онор стоит на пороге своей мечты — поступления в престижный Гарвардский университет. Единственное, что отделяет её от цели, — личная рекомендация строгого и влиятельного учителя мистера Калвина. Однако путь к этой рекомендации преграждает целая очередь таких же амбициозных отличников.
С детства Кейт была воспитана в профессии наёмного убийцы мудрым и безжалостным наставником Ви, который стал для неё и семьёй, и единственным другом. Годы безупречной работы прерываются во время задания в Осаке, где впервые её рука дрогнула, узнав, что цель должна быть уничтожена на глазах у ребёнка. Этот моральный сдвиг предвещает конец карьеры.