В конце девяностых Япония потрясена чередой необъяснимых самоубийств, где все жертвы, несмотря на отсутствие связи, падают с одного и того же здания — Фудзё. Это явление, полное мрачной символики, привлекает внимание Сики Рёги, молодой женщины, одарённой уникальной силой «Смертельного прикосновения» и видящей линии смерти на всём сущем.
Обычный школьник Юйти Акияма возвращается в родной город после семи лет отсутствия, чтобы жить у тёти и продолжить учёбу. С первого дня его ждёт странная атмосфера: заснеженные улицы кажутся знакомыми, а встречи с одноклассницами — Мицуки, Май, Сайори и другими — полны загадок. Каждая из них скрывает личную драму, неожиданным образом переплетающуюся с забытыми детскими воспоминаниями Юйти.
Действие разворачивается в 2029 году, в мире, где кибернетические улучшения стали обыденностью, а информация — самым ценным товаром. Майор Мотоко Кусанаги, боевой киборг с богатым опытом, возглавляет оперативную группу «Отдел 9», занимающуюся борьбой с технологической преступностью. Её следующее дело — выследить таинственного хакера, известного как «Кукловод», способного взламывать не только...