Действие разворачивается в 1994 году, перенося зрителя в эпоху, предшествующую событиям основной серии фильмов о Трансформерах. Сюжет фокусируется на двух новых персонажах — Елене Уоллес, талантливой стажерке музея, и Ное Диасе, бывшем военном эксперте по электронике. Их путь неожиданно пересекается с древним конфликтом, который ведут автоботы-максималы под предводительством Оптимуса Прайма и...
После неудачного эксперимента с жизнь на Мадагаскаре, привыкшие к роскоши львёнок Алекс, зебра Марти, жираф Мелман и бегемотиха Глория решают вернуться в Нью-Йорк. Их самолёт, собранный из подручных средств весёлыми пингвинами, разбивается в африканской саванне. Здесь Алекса ждёт шокирующее открытие: он — принц, наследник царственного львиного клана, выросший в зоопарке и забывший свои корни.