Фильм «Онода» — это не просто военная драма, а глубокое исследование верности, забвения и столкновения двух эпох. Режиссёр Артур Арау (Arthur Harari) с поразительной достоверностью показывает, как лейтенант Императорской армии Хиро Онода и его небольшой отряд, будучи высаженными на остров Лубанг в 1944 году, оказываются в полной изоляции от мира.
Юный Коити Сакакибара, страдающий от болезни лёгких, покидает шумный Токио и перебирается в тихий городок Ёмияму, к родителям своей погибшей матери. Начало новой жизни омрачено странной встречей в больнице: он видит девушку, несущую куклу в морг, её молчаливый и отстранённый вид производит на него сильное впечатление.