Пятая часть культовой франшизы «Миссия невыполнима» переносит зрителя в мир, где границы между друзьями и врагами стерлись. После скандального роспуска МКН (Миссионерской Контрразведывательной Сети) агент Итана Ханта официально не существует. Но когда по всему миру начинают происходить скоординированные террористические атаки, Хант обнаруживает за ними единую руку — «Синдикат».
Том Келлер, один из немногих уцелевших после вспышки загадочного вируса, нашёл временное убежище на покинутой военной базе. Изолированный от мира, он безуспешно пытается установить радиосвязь, надеясь на помощь, и проводит дни в постоянном напряжении, отбиваясь от нападений заражённых, чьи поведение и физиология кардинально изменились.