Действие разворачивается в 2021 году, спустя пять лет после того, как таинственный вирус обрушился на планету, превратив большую часть населения в кровожадных мутантов. Для противостояния угрозе было создано специальное подразделение — Отдел по Борьбе с Заразой (ОБЗ), собравший элитных солдат и специалистов.
Яркое солнце, волны и пляжи Гавайев становятся местом действия нового приключения знаменитой команды расследователей. Шэгги, Скуби-Ду, Фред, Дафна и Велма прибывают на остров, чтобы поддержать Ханахуну в её мечте — победить в престижных соревнованиях по серфингу. Однако радостное событие под угрозой: местные жители тревожат слухи о древнем пророчестве, предвещающем беду, если нарушить покой...