Режиссёр Марк Уэбб предлагает новую интерпретацию истории о Питере Паркере, сосредотачиваясь на его подростковых трудностях и научном любопытстве. После укуса паука Питер не просто обретает силы, а начинает целенаправленно изучать их, создавая механические веб-шутеры и анализируя изменения в своём организме.
Космический шаттл «Черчилль», исследующий комету Галлея, обнаруживает загадочный инопланетный корабль необычной формы. В его трёх стеклянных саркофагах находятся два мужчины и женщина — гуманоиды, кажущиеся спящими. После доставки находки на Землю британское космическое агентство сталкивается с кошмаром: на борту шаттла следы пожара, погибшая команда, а саркофаги остались нетронутыми.