В тихой старшей школе, где кажется, что самое интересное — это уроки и домашние задания, скрывается мир, невидимый обычным людям. Здесь, в стенах здания, полных легенд, обитает Ханако — мальчик-призрак, семилетний дух, который когда-то умер в школьном туалете. Но вместо того чтобы пугать, он оказывается навязчивым, вездесущим и невероятно эгоистичным обитателем.
Академия Камомэ — место, где семь необъяснимых тайн хранит стены старого корпуса. Самой знаменитой среди них считается «Туалетный мальчик Ханако» — дух, который, по легенде, исполнит любое желание, если постучать три раза по дверце кабинки третьего этажа и произнести его имя. Нэнэ Яширо, тихая и застенчивая ученица, решает воспользоваться этой возможностью, чтобы изменить свою судьбу.