Действие разворачивается в небольшом приморском городке Уэльса, где местный доктор Руперт, одиозный учёный с тёмными экспериментами, по ночам выпускает на улицы своего творения — огромную и невероятно агрессивную мышь-убийцу. Существо, ставшее результатом его извращённых опытов, охотится на случайных прохожих, а затем приносит доктору части тел, становясь источником его дальнейших исследований.
Современная подводная лодка, оснащённая передовыми технологиями, отправляется в сложную и опасную экспедицию. Цель команды — тщательно изучить обнаруженный на морском дне объект, чья структура явно носит искусственное происхождение и не вписывается в известные геологические или биологические модели.