В 2011 году во время орбитального ремонта на астронавтов, работавших в открытом космосе, внезапно нападает таинственный рой, вылетевший из лунного кратера. Инцидент уносит жизнь одного члена экипажа, а второго, Брайана Харпера, вынуждают уйти в отставку после его бесплодных попыток доказать НАСА необычную природу случившегося.
События фильма разворачиваются в знаменитой вселенной Людей Икс, где человечество знает о существовании мутантов. История фокусируется на Джин Грей — телепате и телекинетике, чьи способности уже давно находятся на пределе. В ходе опасной спасательной миссии в космосе она подвергается воздействию таинственной космической сущности, которая не только усиливает её сверхчеловеческие способности до...